Le cauchemar des systèmes de coordonnées en bioinformatique est un article accessible et pédagogique publié sur Bioinfo-fr.net qui explique les défis souvent sous-estimés liés à la représentation des positions génomiques dans les fichiers et outils bioinformatiques. Il aborde notamment comment différents formats utilisent des systèmes d’indexation (commençant à 0 ou à 1) et des types d’intervalles (bornes inclusives ou non), des choix qui semblent techniques mais qui peuvent rapidement devenir des sources d’erreurs fréquentes pour qui manipule des génomes, des annotations ou des alignements. Une lecture indispensable pour comprendre et éviter les pièges des coordonnées dans vos analyses de données génomiques.